© 2017 by Gentera Biotechnology Company, All rights reserved.

Gentera Biyoteknoloji Limited Şirketi

DAP Z Ofis 249 numara Merkez M. Seçkin S. No:2-4A

Kağıthane İstanbul

T: 212 632 3025 | bilgi@gentera.com.tr

September 20, 2017

September 11, 2016

February 13, 2016

Please reload

Son Paylaşımlar

Adenomatus Polipozis (FAP) Genetik Testi

September 20, 2017

1/5
Please reload

Tanıtılan Yazılar

Mikroarray Analizi Hakkında Herşey

January 21, 2016

 

Birçok türün tüm genom dizilerinin ortaya çıkarılması ile birlikte, mikroarray analizleri ile genom profillendirme yapılarak hücre, doku ve hastalık düzeyinde birçok diagnostik etkenin araştırılması sağlanmaktadır.

Mikroarray, “çip” olarak adlandırılan cam veya nitroselüloz membran gibi yüzeyler üzerine tutturulan tür ve gen spesifik probların DNA ve RNA çalışmalarında kullanıldığı teknolojidir. Bu sayede kısa sürede ve yüksek hassasiyette çip üzerine işlenmiş tüm probların floresan ışıma değerlerine göre çalışılan numuneye ait yapısal detaylar araştırılabilmektedir [1]. 

 

Mikroarray teknolojisinden, moleküler genetikte DNA, RNA ve metilasyon analizlerinde yararlanılmaktadır. Başlangıç materyali DNA olacak şekilde tek nükleotit polimorfizmi, moleküler karyotipleme, bağlantı analizi (linkage analysis) ve genom boyu ilişkilendirme çalışmalarını (GWAS) gerçekleştirmek mümkündür. Gen ekspresyon analizlerinde ise RNA materyali ile cDNA veya cRNA dönüşümleri tamamlanarak hedef-kontrol karşılaştırmaları yapılmaktadır[2]. Ayrıca ilgili veritabanlarından alınan prob içerikleri ile birlikte miRNA’ların array platformunda çalışılması da mümkün hale gelmiştir. Metilasyon Array analizlerinde ise genom boyu yerleştirilmiş yüzbinlerce CpG probları ile epigenetik araştırmalar yapılabilmektedir [3]. 

 

Mikroarray uygulamaları, günümüzde yaygın olarak Illumina, Agilent ve Affymetrix  platformlarında gerçekleştirilmektedir. Illumina mikroarray çipleri “bead” teknolojisi kullanılarak üretilmiştir ve InfiniumHD, Direct Hybridization gibi çeşitli kimyasal yöntemler ile çalışmaktadır. Illumina’nın sağladığı SNP çip ve metilasyon çip teknolojilerinde her bir proba ait 30 adet kopyanın bir kuyuda yer alması ile çalışmanın hassasiyeti arttırılmıştır [4]. Agilent mikroarray çipleri “Sureprint” ve “Surescan” teknolojileri ile üretilmektedir ve bir çok organizmaya özgü SNP ve ekspresyon çipleri bulunmaktadır [5]. Affymetrix ise “Genechip” teknolojisi ile uzun süredir mikroarray çip üretimini ve hizmet sağlayıcılığını çeşitli ürünleri ile sürdürmektedir [6]. 

 

Klasik teknikler arasında yerini almaya başlayan mikroarray teknolojisinin kullanımında ve analizinde, Gentera Biyoteknoloji olarak size en uygun platform, çip ve materyal seçiminde yardımcı olmaktayız. Mikroarray tabanlı projelerinizde şartlarınıza en uygun dizaynı yapıyor ve çalışmanızın başlangıcından sonuna kadar çözümler üretiyoruz.

 

 

Referanslar

  1. Barbulovic-Nad, I., M. Lucente, et al. (2006). "Bio-microarray fabrication techniques--a review." Crit Rev Biotechnol 26(4): 237-259

  2. Illumina Microarray Systems

  3. Gitan, R. S., H. Shi, et al. (2002). "Methylation-specific oligonucleotide microarray: a new potential for high-throughput methylation analysis." Genome Res 12(1): 158-164

  4. Illumina Microarray Marketing

  5. Agilent Microarray Systems

  6. Affymetrix Microarray Systems

Anasayfa

Please reload

Please reload

Arşiv